На правом высоком берегу Большого Зеленчука близ хутора Прогресс высится холм удивительно правильной формы. Название у этой горы любопытное - Иванча. Как гласит легенда, в незапамятные времена здесь обитала страшная змея по имени Ча. Чтобы избавить людей от чудища, богатырь Иван вступил с ней в единоборство. Во время схватки оба рухнули с обрыва и погибли. От соединения их имен и повелось название местности. Археологические раскопки на склоне холма выявили, что это место древнего городища, где совершались языческие празднества и обряды.
В средние века через район пролегала северная трасса Великого Шелкового пути.
Первоглавенствующее значение на землях округа до того, как прийти на них для оседлой жизни в конце XVIII и первой половине XIX века русским и украинцам, занимали племена Кубанских ногайцев, которые в 1770 году и основали первое поселение на землях нынешнего района аул Карамурзинский.
В 1777 году Россия строит Азово-Моздокскую укрепленную линию из К) крепостей. Чтобы приостановить влияние феодальной Турции на Крымских и ногайских татар, под руководством Л.В. Суворова менее чем за 100 дней, на протяжении 540 км. от Ставрополя до устья Кубани было построено 5 мощных укреплений и 10 редутов, одним из которых являлся Темнолесский ретраншемент, который располагался у бровки южного склона горы Стрижамент, в дальнейшем из ретраншемента возникла крепость, просуществовавшая до середины XIX века. Вскоре на поверхности плато возник поселок Стрижамент, первоначально называвшийся Форштадт. В лесу, окружающем верховые балки Темной, со времен крепости сохранилось старое кладбище, где на могилах можно увидеть кресты, высеченные из «стрижаментского» известняка-ракушечника. В двух километрах от крепости, на восточном склоне Стрижамента, в верховьях реки Егорлык, возникла станица Новоекатериновская, первоначально называвшаяся поселком Бабским. Это было связано с тем, что он заселялся семьями солдат, служащих в крепости, или специально поселяемыми здесь ссыльными женщинами.
Накануне отмены крепостного права в России, на территории округа на левом берегу Кубани было еще много пустующих земель. Ни села Богословское (Балахоновского), ни Ольгинского (Кочубеевского), ни Казьминского, ни Ивановского еще не было. И сколько видел глаз всюду бескрайняя степь и степь, нигде ни кустика, ни деревца. Весной эта степь покрывалась цветущим ковром сочных душистых трав.
Чтобы укрепить Кубанскую границу, царское правительство решило перевести на нее донских и волжских казаков. В течении четырех лет - с 1824 до 1827 годов, в верховьях Кубани появились станицы хоперских казаков, переселенных из глубины края: Баталпашинская, Беломечетская, Невинномысская, Барсуковская.
С 1875 года, т.е. со времени окончания строительства Владикавказской железной дороги, жизнь станиц Правобережье Кубани, сел, аулов Левобережья изменяется коренным образом. Проведение железной дороги способствует консолидации хозяйственно - экономических отношений местного населения со всеми казачьими областями Дона, Кубани и Терека.
В первые годы Советской власти территория округа относилась к Кочубеевской области. 19 июля 1924 года Армавирский округ Кубано-Черноморской области был разделен на двенадцать районов. Одним из них был Невинномысский район с цен гром в станице Невинномысской.
Декретом ВЦИК от 26 января 1925 года было утверждено положение о Северо-Кавказском крае с центром в городе Ростове-на-Дону. Следовательно, в 1925 году территория округа относилась к Невинномысскому району Армавирского округа Северо-Кавказского края.
23 января 1935 года на основании постановления ВЦИК образуется Либннехтовский район с центром в селе Великокняжеском.
2 ноября 1956 года Указом Президиума Верховного Совета РСФСР Либннехтовский район упразднен, сельские Советы со всеми населенными пунктами переданы в состав Невинномысского района.
В 1959г. город Невинномысск отнесен к категории городов краевого подчинения, в связи с этим Невинномысский район переименован в Кочубеевский.
14 августа 1959 года Указом Президиума Верховного Совета РСФСР был образован Кочубеевский район с центром - село Ольгинское.
В 1961 году села Ольгинское и Великокняжеское объединены в один населенный пункт - село Ольгинское, в апреле того же года его переименовали в с. Кочубеевское.
В ноябре 2004 году Кочубеевский район стал муниципальным. В его состав вошло 15 муниципальных образований, состоящих из 51 населенного пункта.
С 01 янаря 2021 года Кочубеевский муниципальный район реорганизован в Кочубеевский муниципальный округ.
